針對媒體報導中小學教師行政工作獎金地方加碼案延宕一事，教育部澄清，已建置全國一致性的行政工作獎金制度，並對地方政府規劃強化教師行政支持措施持高度肯定與樂觀支持態度，在地方政府提出加碼構想後，即主動提供更具彈性且可加速辦理之作法，並無卡關或延宕情形。
教育部指出，現行行政工作獎金依「公立學校教師獎金發給辦法」辦理，已自2025年9月1日起實施，提供校長、主任及組長等行政人員每月1,000至2,000元，為全國一致之制度設計。中央核定之行政工作獎金相關經費，已於2026年1月撥付各地方政府，供學校依制度發放基本核給，地方政府如欲在此基礎上進一步加碼，係屬額外措施。
針對台北市政府擬加碼行政教師獎金之訴求，教育部獲知後，即主動聯繫台北市教育局，說明本部核定「公立學校教師獎金發給辦法」發給行政工作獎金，係屬全國一致性基本核給。若要加碼，可依行政院人事行政總處2015年6月12日總處給字第1040037166號函參照公務人員激勵機制，額外給予行政教師實質支持(亦即發給激勵獎金)。此做法之優點在於無須修正全國性的獎金發給辦法，可大幅簡化行政流程，並能協助地方政府儘速完成發給作業。相關規定雖以「次」為發放單位，但並未限制發放次數與週期，各地方政府可依實際需求及財政條件，規劃常態性或分階段發放措施及方式，具高度彈性。
教育部強調，已於3月17日正式函覆台北市政府，並同步轉知各地方政府，明確建議地方政府可透過激勵獎金發放，審酌各地方政府財政條件及學校實際行政負擔情形，加速辦理行政教師激勵措施，同日並致電相關地方政府，說明可行建議作法。教育部表示，提升教師兼任行政職務之意願，是穩定校務運作的核心關鍵，並將在法規完備與程序輔導上給予最大協助。
